分公司是總公司的一個分支機構，當總公司注銷時，分公司同樣面臨注銷的命運，在分公司清算注銷賬務處理方面，可以參照《中華人民共和國公司法》關于公司破產清算注銷程序中的相關規定來進行。
一、清算準備工作：
(一) 成立清算組。
(二) 展開清算工作。
清算組自成立之日起接管公司，開展以下業務：接管公司財產;了結公司未了業務;收取債權、清理債務;分配剩馀財產;注銷公司法人資格，吊銷營業執照。
(三)、通知債權人申報債權。
(四)、提出清算方案。
清算組在清理公司財產、編制資產負債表和財產清單后，擬定提出清算方案，報股東會討論通過或者主管機關確認。
二、在公司清算前，應當于公司終止經營日編制資產負債表，和正常經營日的資產負債表的編制是一致的。
在公司注銷前，公司應該先進行注銷前的清算。公司注銷前清算的賬務處理分為以下幾個步驟：先編制公司解散的資產負債表;然后核算清算費用;核算變賣財產物資的損益;再接下來核算并收回公司賬面債權，清償公司債務及核算公司損益;再核算彌補以前年度虧損;核算剩余財產及其分配;最后編制清算損益表和清算結束的資產負債表。下面具體介紹一下公司注銷前清算的賬務處理。
三、在公司注銷清算過程中，要設置清算費用和清算損益兩個基本賬戶。
1.清算費用用于專門核算公司注銷清算期間的各項成本費用，主要包括清算機構成員的工資報酬，公告費用，咨詢費用和辦公費用，訴訟費用及清算過程中必須支付的其他的清算費用，這些費用從現有財產中優先支付。在清算費用賬戶借方登記清算期間的各項清算費用，在清算結束時，將其全部發生額從該賬戶的貸方轉入清算損益的借方，本賬戶無余額。
2.清算損益屬于損益類賬戶，專門核算公司注銷清算期間所實現的各項收益和損失。清算損益賬戶的貸方反映公司的清算收益，其內容包括清算中發生的財產盤盈，財產重估收益，財產變現的收益和無法償還的債務等;清算損益賬戶的借方反映公司的清算損失，主要包括清算發生的財產盤虧，包括損失財產，變現損失和無法收回的債權;期末余額可能在貸方也可能在借方，再將余額轉入未分配利潤賬戶。清算結束時，該賬戶無余額。若利潤分配下設的未分配利潤的余額在貸方，再核算彌補以前年度虧損，若彌補虧損后，還有貸方余額，要繳納清算年度所得稅，最后若有剩余財產，將公司注銷清算的剩余財產按實收股本的份額，在各個所有者之間進行分配。
四、在公司注銷清算結束后，編制清算資本的資產負債表和清算損益表。
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